Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacl1Q9QXE0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacl1Q9QXE0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacl1Q9QXE0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacl1Q9QXE0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacl1Q9QXE0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacl1Q9QXE0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacl1Q9QXE0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacl1Q9QXE0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacl1Q9QXE0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacl1Q9QXE0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms