Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms