Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc4apQ9JLV2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms