Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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