Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms