Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms