Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Mrpl39Q9JKF7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mrpl39Q9JKF7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mrpl39Q9JKF7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mrpl39Q9JKF7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mrpl39Q9JKF7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Mrpl39Q9JKF7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mrpl39Q9JKF7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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