Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms