Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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