Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Alyref2Q9JJW6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Alyref2Q9JJW6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Alyref2Q9JJW6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Alyref2Q9JJW6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Alyref2Q9JJW6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Alyref2Q9JJW6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Alyref2Q9JJW6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Alyref2Q9JJW6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Alyref2Q9JJW6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Alyref2Q9JJW6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Alyref2Q9JJW6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Alyref2Q9JJW6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Alyref2Q9JJW6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms