Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Bco1Q9JJS6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Bco1Q9JJS6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bco1Q9JJS6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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