Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efcc1Q9JJF6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms