Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog8Q9JJA2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog8Q9JJA2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms