Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpf2Q9JJ80 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms