Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb3Q9ERD7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms