Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms