Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms