Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms