Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop7Q9DCH2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms