Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms