Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms