Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms