Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swt1Q9DBQ9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms