Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms