Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms