Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem38bQ9DAV9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms