Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Asf1bQ9DAP7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms