Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms