Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms