Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4bQ9D8B3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms