Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp5Q9D7S9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp5Q9D7S9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms