Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmem54Q9D7S1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmem54Q9D7S1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmem54Q9D7S1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmem54Q9D7S1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmem54Q9D7S1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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