Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc52a3Q9D6X5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms