Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Rab11fip1Q9D620 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Rab11fip1Q9D620 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rab11fip1Q9D620 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rab11fip1Q9D620 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rab11fip1Q9D620 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rab11fip1Q9D620 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rab11fip1Q9D620 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rab11fip1Q9D620 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rab11fip1Q9D620 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rab11fip1Q9D620 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rab11fip1Q9D620 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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