Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms