Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox2aQ9D4Y3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox2aQ9D4Y3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms