Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms