Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms