Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam90a1bQ9D4F3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms