Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D454 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D454 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D454 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D454 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D454 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D454 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D454 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D454 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D454 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D454 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms