Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms