Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D930007J09RikQ9D2K6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms