Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H0

Rita1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rita1Q9D1H0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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