Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms