Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms