Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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