Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms