Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gins3Q9CY94 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gins3Q9CY94 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms