Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ube2fQ9CY34 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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