Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms